城市自来水厂所采用的净水过程是混凝―澄清―过滤―加氯杀菌模式，以上过程一般可以保证自来水的澄清和无菌，但是，大部分的溶解性污染物和天然有害杂质在这种简单过程中是无法完全被清除的。
　　另外，自来水在输送和储存中也很有可能被污染。在水中污染物中，最有害的恰恰是那些肉眼看不到的溶解物。因此将自来水和饮用水分开供应已成为发达国家的一个潮流。
　　自来水出厂后还要经过漫长的管网，输水管道年久失修，就会产生很多铁锈；有的地区自来水供水压力较低，必须进行二次加压，设置了水池，水塔、楼顶水箱等，这些都会造成二次污染。尤其是楼顶水箱，有的管理不当，只有人用，没有人修，二次污染更为严重。居民水管中放出来的自来水，已含有铁锈、汞、铅、酚、氨氮、致病微生物、农药等。部分地区的自来水已不合乎饮水卫生标准。多数高层住宅水箱二三年没有清洗过，揭开水箱盖，一群蚊蝇从水面上腾空而起，水里还有一些不知名的虫子。把水抽干后，水箱内一股臭味扑鼻而来，池底淤泥约有10厘米厚。在蓄水池或者水箱时还发现过死老鼠、死鸽子等等，而水箱生蛆、长蚊子更是司空见惯。“可以这么讲，水箱什么脏东西都有！供水管网各个饮水点（自来水龙头）排水过程会引起负压，将空气中的细菌等有害物质输入管网内，造成二次污染。
一般的净水器采用物理拦截方式去除水中的杂质的同时，将这些杂质留在滤水器中，需要过滤的水都要经过这些杂质，长时间使用就会对水质产生二次污染，同时，细菌也会在过滤介质中从而大大增加滤水中的细菌含量，由于滤芯更换的不及时就会造成人们常说的净水器变成“污水器”，“臭水器”。与此不同反渗透将原水分成两部分，即纯水和浓水，纯水有透过反渗透膜的水分子组成，浓水由剩余分子和源水中的杂质组成，浓水包括细菌，病毒在内的杂质被纯水机排除，从而实现自我清洗不会造成二次污染。
　　矿泉水是指那些含有一定矿物质的水，指山泉水或地下水。一般来说，矿泉水的污染小于自来水，但是由于大气污染的流动性，即使地下水也或多或少地被溶解在雨水中的空气污染物污染。虽然人体从水中吸收矿物质的能力非常有限，但矿泉水中的某些矿物质确实可能对人体有益。值得注意的是有些矿物质的含量过高则对人体有害。
　　纯净水除能防止自然污染和人为污染对人体的侵害以外，纯净水的矿物质含量一般很低，对减低人体肾脏的工作压力有利。同时较低的含盐率对结石病，心血管病，高血压病的缓解会有帮助。
　　饮用低矿物质含量的纯净水是否会造成人体矿物质缺乏？据美国环保局1995年关于饮水的年度报告，人体主要是从食物中吸收与蛋白质结合在一起的矿物质，而从水中吸取无机矿物质的能力很低，人体中钙的主要来源是食物而不是饮水中的物质。
　　为了避免水中不良物质对人体的危害，人们应该在煮饭，烧汤和饮用等情况下都使用非污染水。在解决家庭水质污染方面，自制纯净水更有优势，因为它可以保证将污染清除，又可以就地生产而不必长途运输。
　　长期以来，人们认为喝开水是安全的。其实，喝开水只在不会引起腹泻这一点是正确的水中的有害病毒和有害重金属离子两大类，实验证明，只有煮沸15分钟以上才能将所有细菌杀死，而一般将水烧开则只能杀死部分细菌，被杀死的细菌尸体腐烂后形成“败落晶”（致癌物）会对人体产生不良反应。美国家庭早已没有喝开水的事情。而水中的重金属类（汞，铅，镉，砷等），可致癌的硝酸盐，硝酸盐离子和放射性物质，有毒农药及工业污染物是不能通过煮沸的方法来去除的。因为烧开水过程并不能除去水中那些会引起慢性疾病的杂质，铅污染，农药，杀虫剂等。目前去除水中的有害金属离子的方法有三种，即蒸馏水，离子交换法和反渗透法，最彻底最安全的是反渗透法，它能将饮水中的所有有害杂质去除使饮用纯净甘甜保证饮水健康可以说，反渗透法是目前为止最完善的净水技术。
　　桶装纯净水配饮水机已为广大家庭所接受但也存在不安全隐患，桶装纯净水在启封前可以保证卫生安全但启封后24小时就会产生大量的亚硝酸盐（高制癌物）每喝一杯纯净水就会有一杯空气进入桶内。越纯净的水越容易造成二次污染。另外，水桶与饮水机的接封处也会有空气杂质的进入造成二次污染。